生命システム工学特別実験２Ｂ

Advanced Biotechnological Experiment 2B

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83GRRES612

西野　達哉

Tatsuya Nishino

2026年度後期

2026年度

②Second semester

集中講義

Integrated lectures

先進工学研究科　生命システム工学専攻

Department of Biological Science and Technology, Graduate School of Advanced Engineering

4.0単位

卒業研究（研究指導）

Graduation research(Research Guidance)

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① [対面]対面授業/ [On-site] On-site class

染色体構造生物学に関する研究を行う。
卒業研究で培った実験技術を活かし、新たな発見を目指すため、関連因子のクローニング、タンパク質の発現・精製・生化学的解析を行い、機能解析を進める。さらに、立体構造解析を通じて、原子レベルでその機構を理解する。
加えて、再構成系の構築や新たな機構の創成など、よりチャレンジングなテーマにも取り組む。
　
Research on chromosome structural biology is conducted.
To make new discoveries by utilizing the experimental techniques acquired through graduation research, we perform cloning of related factors, protein expression, purification, biochemical analysis, and functional characterization. Furthermore, we aim to understand mechanisms at the atomic level through three-dimensional structural analysis.
Additionally, we take on more challenging themes, such as constructing reconstitution systems and exploring novel mechanisms.

染色体構造生物学に関する実験を通じて、問題解決力を養うとともに、研究の計画立案やデータ解析の能力を身につける。　
Acquire problem-solving skills through experiments on chromosome structural biology, while also developing the ability to design research plans and analyze data.

染色体構造生物学における未解明の課題を見出し、指導教員とともに研究計画を立案・遂行し、得られた結果を考察できるようになることを目指す。
We aim to identify unresolved issues in chromosome structural biology, formulate and execute research plans with academic advisors, and analyze the results.

生命システム工学特別輪読2B, 生命システム工学特別演習2Bと合わせて受講すること。
Take the lectures of Bioengineering special reading 2B, Bioengineering special exercise 2B together.

ディベート・ディスカッション　Debate/Discussion／グループワーク　Group work／プレゼンテーション　Presentation

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実験を行うにあたり、必要な知識や手順を習得し、使用する試薬や器具を調査・準備すること。
また、実験後は得られた結果を解釈・考察し、次に必要な方針を立てること。
Prepare by acquiring the necessary knowledge and procedures for conducting the experiment, and investigate and arrange the required reagents and equipment.
After the experiment, analyze and interpret the obtained results, then determine the next necessary course of action.

研究室での日々の研究活動や議論の成果を総合的に評価する。
The student's daily research activities and discussions in the laboratory will be comprehensively evaluated.

・S：到達目標を十分に達成し、極めて優秀な成果を収めている
・A：到達目標を十分に達成している
・B：到達目標を達成している
・C：到達目標を最低限達成している
・D：到達目標を達成していない
・-：学修成果の評価を判断する要件を欠格している

・S：Achieved outcomes, excellent result
・A：Achieved outcomes, good result
・B：Achieved outcomes
・C：Minimally achieved outcomes
・D：Did not achieve outcomes
・-：Failed to meet even the minimal requirements for evaluation

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教科書および一部の参考書は、MyKiTS (教科書販売サイト) から検索・購入可能です。
​https://gomykits.kinokuniya.co.jp/tokyorika/​​​

It is possible to search for and purchase textbooks and certain reference materials at MyKiTS (online textbook store).
​​https://gomykits.kinokuniya.co.jp/tokyorika/

解析ターゲットを選定し、遺伝子のクローニング、タンパク質の発現・精製などの生化学実験を行う。
結晶化に十分な量のタンパク質が精製でき次第、タンパク質の結晶化を実施する。
得られた結晶は放射光施設でX線照射を行い、回折データを取得する。
取得した回折データをもとに構造決定を進める。
構造決定後は、立体構造を基にした生化学的解析や再構成実験、タンパク質のデザインを行い、細胞や個体レベルでの研究へと発展させる。
1日あたりの実験時間は進捗状況に応じて異なるが、研究に必要な知識・技術・経験を習得するため、原則としてすべての研究室での実験を対面で行うことを求める。
Select target proteins and conduct biochemical experiments, including gene cloning, protein expression, and purification.
Protein crystallization will be performed once a sufficient amount of purified protein is obtained.
The obtained crystals will be exposed to X-rays at a synchrotron radiation facility to collect diffraction data.
Structure determination will be carried out based on the obtained diffraction data.
After structure determination, biochemical analysis based on the three-dimensional structure, reconstitution experiments, protein design, and further studies using cells or organisms will be conducted.
The daily experimental duration varies depending on the progress of the research, but in principle, to acquire the necessary knowledge, skills, and experience for research, students are generally required to conduct experiments in the laboratory.

国内外の研究機関で25年間の研究経験を活かし、研究計画の立案・遂行および研究成果の取りまとめの指導に反映する。
Drawing on 25 years of research experience at domestic and international institutions, I apply this expertise to the planning, execution, and compilation of research findings.

Signals ChemDraw（旧ChemOffice Professional）／Discovery Studio, Materials Studio／-

PyMOL/Phenix/Coot/Chimera

所定の期間在学し、「自然・人間・社会とこれらの調和的発展のための科学と技術の創造」という教育理念と、
「豊かな人間性・創造力と国際性を兼ね備え、多面的かつ新しい視点を持って科学技術の発展に貢献できる人材の育成」という教育目標に沿って編成された授業科目を履修して、所定の単位を修得した学生に対して修了を認定し、修士(工学)の学位を授与する。
The educational philosophy of studying in the prescribed period and creating "science and technology for nature, human beings and society and these harmonious development"
Students should take the courses organized according to the educational goal of "cultivating human resources capable of contributing to the development of science and technology with a rich humanity creativity and international characteristics, with a multifaceted and new perspective"
Certificate of Master of Science (Engineering) will be awarded to students who completes the course.

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