特別研究１B （新田）

Advanced Research 1B

990C956

03GRRES502

室　龍之介、新田　剛

Takeshi Nitta, Ryunosuke Muro

2026年度後期

2026年度

②Second semester

集中講義

Intensive Course

生命科学研究科

Graduate School of Biological Sciences

3.0単位

卒業研究（研究指導）

Graduation research(Research Guidance)

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① [対面]対面授業/ [On-site] On-site class

免疫応答および免疫病態におけるT細胞の分化、選択、活性化の制御機構について分子レベルで理解するために実験を中心とした研究を行う。
Students will conduct a research mainly accompanying experiments in order to understand mechanisms of T cell differentiation, selection, and activation in the immune responses and pathogenic conditions at molecular levels.

分子細胞生物学・免疫学・遺伝学等の知識と研究技術を習得し、それを基に、上記のうち未解明の問題を明らかにするために研究を行い、その結果をまとめ、部門内ミーティング、学内発表会や学会で発表できる能力を身につける。本研究科のディプロマポリシー「生命科学における高度な技術を習得することで、これを駆使して、生命科学諸分野の課題の解決に貢献できる研究能力」を身に付ける科目である。
Students will acquire knowledge of molecular cellular biology, immunology, genetics, and so on, and learn methodologies used for research. Based on that, students will conduct a research to uncover unsolved problems in such area, summarize and present their results at lab meetings, as well as internal and external meetings.

免疫学における未解決の問題を理解し、これを研究を通して解決する能力、研究成果を整理分析し、まとめ、人に説明し、発表できる能力を身に付ける。
Students will understand unsolved questions in the field of immunology and acquire an ability to solve such questions through research. Students will also be able to acquire ability to analyze and summarize the results, and to explain and present the outcome to others.

毎日の研究活動の他に、毎月の論文詳読会と研究報告会に参加すること。
Students will need to attend monthly lab meetings (the progress report and the journal club) besides engaging in their daily research activities.

ディベート・ディスカッション　Debate/Discussion／プレゼンテーション　Presentation／実験　Experiments／実習　Practical learning

自分の研究に関連する原著論文をPubMed等で探して読み、その内容を研究計画や結果解析等について考える材料にすること。
Students will need to find through a search engine (e.g. PubMed) and read original papers that are related to their research theme, in order to make good use of the contents of such papers for their research planning and analyses of their results.

自分の研究に関連する原著論文をPubMed等で探して読み、その内容を研究計画や結果解析等について考える材料こと。
Students will need to find through a search engine (e.g. PubMed) and read original papers that are related to their research theme, in order to make good use of the contents of such papers for their research planning and analyses their results.

研究に対する姿勢と研究成果を総合的に判断する。
Evaluated by their performance and enthusiasm in their research activity and the results of the research as a whole.

・S：到達目標を十分に達成し、極めて優秀な成果を収めている
・A：到達目標を十分に達成している
・B：到達目標を達成している
・C：到達目標を最低限達成している
・D：到達目標を達成していない
・-：学修成果の評価を判断する要件を欠格している

・S：Achieved outcomes, excellent result
・A：Achieved outcomes, good result
・B：Achieved outcomes
・C：Minimally achieved outcomes
・D：Did not achieve outcomes
・-：Failed to meet even the minimal requirements for evaluation

Y

エッセンシャル免疫学　第4版 (Peter Parham(著)、平野俊夫(監訳)、MEDSiメディカル・サイエンス・インターナショナル、2023年刊行)
免疫生物学 - Janeway’s Immunobiology - 第9版 (Kenneth Murphy, Paul Travers, Mark Walport(著)、笹月健彦(監訳)、南江堂、2019年刊行)

教科書および一部の参考書は、MyKiTS (教科書販売サイト) から検索・購入可能です。
​https://gomykits.kinokuniya.co.jp/tokyorika/​​​

It is possible to search for and purchase textbooks and certain reference materials at MyKiTS (online textbook store).
​​https://gomykits.kinokuniya.co.jp/tokyorika/

研究テーマに関連する英語論文、総論を参考にする。
Original papers and reviews, being related to the students' research, published in scientific journals.

【特別研究の概要】
1) 研究の立案に必要な該当研究分野の研究成果・現状について、学術論文を中心に資料収集を行い、研究方針を決定する。
2) 研究遂行に必要な研究技術・設備について議論し、新技術導入が必要な場合は技術習得のために関連研究室の教員と連携する。
3) 研究開始後は1ヶ月単位で成果の進捗状況を確認・議論し、問題が生じた場合はその解決法を議論する。
4) 成果は、1ヶ月に一回の頻度で研究室ゼミで発表し、他研究室教員と研究成果ならびに方針について意見交換する。
5) これら全般を通して、研究者・技術者としての基礎的技能を滋養することを目標とする。

【授業計画】
第1回：生命科学基礎的研究手法の習得：遺伝子組換えの基本ルールを理解し、大腸菌の培養、プラスミドの調整ができる。
第2回：生命科学基礎的研究手法の習得：PCRによるDNA増幅とその解析ができる。
第3回：生命科学基礎的研究手法の習得：DNA組換え、形質転換、プラスミドの解析ができる。
第4回：生命科学基礎的研究手法の習得：発現ベクターのトランスフェクションができる。
第5回：生命科学基礎的研究手法の習得：レトロウイルスベクターの作製と細胞への感染ができる。
第6回：生命科学基礎的研究手法の習得：RNAの調製とcDNAの作製ができる。
第7回：生命科学基礎的研究手法の習得：Real-Time PCRによるmRNA発現解析ができる。
第8回：研究テーマの立案：研究室で進行中の研究を把握し、関連論文を参考にして、自分の研究テーマを1つ以上立案する。
第9回：研究計画：研究目標を定め、それに対する研究計画を立てる。
第10回：研究計画：具体的な実験計画をたて、必要な材料や技術について準備する。
第11回：研究計画の実行：研究材料を準備し、実験を開始する。
第12回：研究計画の実行：計画通りに実験を進める。
第13回：研究計画の実行：計画通りに実験を進め、それまでのデータをまとめて報告し、研究室のメンバーと議論し、必要に応じて計画を修正する。
第14回：研究計画の実行：さらに実験を進める。
第15回：研究のまとめ：データをまとめて、結果を研究報告会で報告する。

【研究分野】
胸腺でT細胞がつくられるメカニズムを明らかにし、免疫系の基本原理を理解するための研究を行う。
・胸腺微小環境の形成機構
・T細胞の正の選択・負の選択
・胸腺の退縮のしくみと意義
・ガンマデルタT細胞の生成機構
・免疫細胞の進化的起源


[Outline]
1) Students need to collect and read scientific papers describing current progress of the corresponding research field that are necessary for planning of their research, and make their research plan.
2) Students need to discuss on technics and devises required for their research with colleagues, and, if necessary, collaborate with other laboratories to introduce new technologies.
3) After starting their research, students need to discuss about the results every month with instructors to find out solutions to any problems.
4) Students need to present their results at the lab meeting once a month, and discuss with colleagues about the results and future plans.
5) Through these activities, students will acquire basic skills for researchers or technical experts.

[Course plan]
I. Learning of basic methods for life science research:
1. Students will learn basic rules for gene recombination experiments, and learn basic techniques in molecular biology such as E. coli culture and plasmid preparation.
2. Students will learn how to amplify DNA by PCR and analyze the products.
3. Students will learn techniques for DNA recombination, transformation, and analyses of plasmids.
4. Students will learn how to transfect expression vectors into mammalian cells.
5. Students will learn how to make retroviral vectors and to infect mammalian cells.
6. Students will learn how to prepare RNA and to make cDNA.
7. Students will learn how to evaluate mRNA expression by Real-Time PCR.
II. Decision of research subject:
8. Students will think of one or more research subject considering the researches on going in the laboratory and related papers.
III. Planning of the research:
9. Students will set a goal of the research and plan a road map.
10. Students will plan experiments in detail and investigate necessary materials and methods.
IV. Execution of the research:
11. Students will prepare necessary materials and start experiments.
12. Students will carry out the experiments according to the plan.
13. Students will carry out the experiments, analyze and present the data, discuss about the data with lab members, and plan the next step or revise the plan if necessary.
14. Students will carry out the experiments as 13.
V. Summarizing the research:
15. Students will summarize the data, and present the results in the lab meeting.

[A research area]
Students will conduct a research to clarify the mechanism by which T cells are produced in the thymus and to understand the basic principles of the immune system;
・Mechanisms of thymic microenvironment formation
・Positive and negative selection of T cells
・Mechanisms and significance of thymic involution
・Mechanisms of γδT cell generation
・Evolutionary origins of immune cells
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