化学特別研究1B （塚越）

Special Research in Chemistry 1B

991K413

13GRRES505

塚越　かおり

Kaori Tsukakoshi

2026年度後期

2026年度

①First semester

集中講義

All days

理学研究科　化学専攻

Department of Chemistry, Graduate School of Science

2.00単位

卒業研究（研究指導）

Graduation research(Research Guidance)

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① [対面]対面授業/ [On-site] On-site class

当研究室は、アプタマー/タンパク質のエンジニアリングと応用を通して新たな生化学研究を拓くことを目指す。既存の生体分子間に存在する生化学に加え、DNA・RNAからなるリガンドであるアプタマーや、遺伝子工学あるいはタンパク質科学的な手法で開発可能な人工タンパク質などの、新規分子の開発をきっかけとして生じる新しい生化学的な機構を研究することで、目標を達成する。応用分野・実施例として、神経変性疾患に係るタンパク質を取り扱う。in vitro実験だけでなく、細胞・動物・ヒト由来組織などを対象とした研究も実施し、生化学分野だけでなく、医学的に意義のある研究成果の導出も目指す。以下４つの研究項目があり、配属学生は１つ以上のテーマに関連する研究を実施する。

（１）アプタマーの探索とその結合メカニズムの解明
（２）アプタマーによるタンパク質機能の制御とその制御メカニズムの解明
（３）微生物由来有用酵素のバイオセンシングへの応用
（４）アプタマー・酵素・抗体を組み合わせた新規センシングシステムの開発

Our laboratory aims to pioneer novel biochemical research through aptamer/protein engineering and its applications. We will achieve this goal by studying new biochemical mechanisms arising from the development of novel molecules, including aptamers—ligands composed of DNA or RNA—and artificial proteins developed through genetic engineering or protein science techniques, in addition to the biochemistry inherent in existing biomolecules. As application fields and examples, we handle proteins related to neurodegenerative diseases. We conduct research not only in vitro but also using cells, animals, and human-derived tissues, aiming to produce medically significant research outcomes beyond the biochemical field. There are four research items below, and assigned students will conduct research related to one or more of these themes.

(1) Aptamer discovery and elucidation of their binding mechanisms
(2) Control of protein function by aptamers and elucidation of their regulatory mechanisms
(3) Application of useful enzymes derived from microorganisms to biosensing
(4) Development of novel sensing systems combining aptamers, enzymes, and antibodies

１． 与えられたテーマの中で自ら目標を設定し、その目標を達成するため知識の習得・技術の向上・論理的思考法の構築などに精力的に取り組むことができるようになる。
２． 設定された目標を達成するための実験技術を習得し、データを取得できるようになる。
３． あらゆる職種に必要な企画力や行動力・熱意や意欲の育成に役立てることができるようになる。
４． 研究室内外の人たちと情報を交換し、協力しあいながら研究を進めていく協調性やコミュニケーション能力を習得することができるようになる。

1.  Within a given theme, students will be able to set their own goals and energetically pursue knowledge acquisition, skill improvement, and the development of logical thinking methods to achieve those goals.
2.  Students will acquire the experimental techniques necessary to achieve their set goals and become capable of obtaining data.
3. Develop the planning skills, initiative, enthusiasm, and motivation essential for any profession.
4. Acquire the coordination and communication skills necessary to exchange information and collaborate with people both inside and outside the laboratory to advance research.

１年次であるので、新たな研究計画の立案と研究の遂行によるデータの取得を目標とする。
四年生で実施した実験の枠組みを超えて、新たな解析・分析手法へ挑戦し、より理学的な研究に向けた研究データの導出に挑戦する。
また、国内・国際学会での発表などを通して、研究内容を発信できるようになることを目標とする。

As this is the first year, the goal is to formulate a research plan and acquire data through the execution of research. Additionally, the goal is to become capable of disseminating research content through presentations at domestic and international conferences.

課題に対する作文　Essay／ディベート・ディスカッション　Debate/Discussion／プレゼンテーション　Presentation／反転授業　Flipped classroom／実験　Experiments／実習　Practical learning

ゼミへの出席とプレゼンテーション、研究室における教職員あるいは学生への態度、
実験に対する取り組み、安全な研究室運営への貢献、研究成果とを合わせて、総合的に評価する。

Attendance at seminars and presentations, attitude toward faculty and students in the laboratory, commitment to experiments, contribution to safe laboratory operations, and research achievements will be evaluated comprehensively.

・S：到達目標を十分に達成し、極めて優秀な成果を収めている
・A：到達目標を十分に達成している
・B：到達目標を達成している
・C：到達目標を最低限達成している
・D：到達目標を達成していない
・-：学修成果の評価を判断する要件を欠格している

・S：Achieved outcomes, excellent result
・A：Achieved outcomes, good result
・B：Achieved outcomes
・C：Minimally achieved outcomes
・D：Did not achieve outcomes
・-：Failed to meet even the minimal requirements for evaluation

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教科書および一部の参考書は、MyKiTS (教科書販売サイト) から検索・購入可能です。
​https://gomykits.kinokuniya.co.jp/tokyorika/​​​

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必要に応じて指定する。
Specify as required

すべての授業を対面で受講することを求める。

前半：
　生化学系実験を駆使し実験データを出す。また、更なる解析・分析へと展開するために、新たな基本的な実験手技を身につける。
　また、各々の研究テーマに関連する分野の文献を複数精読し、研究に対するバックグラウンドを理解する。
　指導教官とのディスカッションを通し、実験・研究計画を立案し、予備実験を行うなどして実験の準備を進める。
　研究報告会では、自身の実験・研究計画と予備実験の成果を発表する。
　学会発表も視野に入れて活動する。

後半：
　立案した実験計画に基づき、引き続き実験を行いデータを取得する。
　加えて、指導教官とのディスカッションを通して、より自身の実験・研究の理解を深めていく。
　研究報告会では、自身の実験・研究計画に沿って実験の結果を発表し、次の実験の計画立案に繋げていく。

First Semester:
Utilize the biochemical experimental techniques learned in the fourth year to generate experimental data. Additionally, acquire new fundamental experimental techniques to advance toward further analysis and interpretation.
Furthermore, thoroughly read multiple literature sources relevant to each research theme to understand the background of the research.
Through discussions with the supervising professor, formulate experimental and research plans, and advance experimental preparations by conducting preliminary experiments.
At the research progress meeting, present your experimental/research plan and the results of the preliminary experiments.

Second Semester:
Continue conducting experiments based on the planned experimental design to collect data.
Additionally, deepen your understanding of your own experiments and research through discussions with your advisor.
At the research progress meeting, present the results of your experiments according to your experimental/research plan and use this to develop plans for subsequent experiments.

国内の研究機関（生物系）での研究員として勤務した経験を活かして、指導を執り行う。

Leveraging my experience working as a researcher at a domestic research institution (in the biological sciences), I will provide guidance.

Signals ChemDraw（旧ChemOffice Professional）

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