特別研究１B （波江野）

特別研究１B （波江野）

990C950

03GRRES502

佐伯　晃一、波江野　洋

Hiroshi Haeno

2026年度後期

2026年度

②Second semester

集中講義

Intensive Course

生命科学研究科

Graduate School of Biological Sciences

3.00単位

卒業研究（研究指導）

Graduation research(Research Guidance)

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① [対面]対面授業/ [On-site] On-site class

生命科学に関連する現象について数理モデリングや情報解析の手法を用いて研究を行う。

Students will conduct a theoretical research accompanying mathematical modeling or information analysis in order to reveal a phenomena related to life science.

数理モデリングや情報解析手法の技術を身につけ、生命現象に対して応用し、未解明の問題を明らかにするための研究を行う。その結果をまとめ、部門内ミーティング、学内発表会や学会で発表できる能力を身につける。
本研究科のディプロマポリシー「生命科学における高度な技術を習得することで、これを駆使して、生命科学諸分野の課題の解決に貢献できる研究能力」を身につける科目である。

Students will acquire knowledge of mathematical modeling and information analysis. Based on those, students will conduct a research to uncover unsolved problems related to life science, summarize and present their results at lab meetings, as well as internal and external meetings.

生命科学における未解明の問題を理解し、これを研究を通して解決する能力、研究成果を整理分析し、まとめ、人に説明し、発表できる能力を身につける。　　

Students will understand unsolved questions in the field of life science and acquire an ability to solve such questions through research. Students will also be able to acquire ability to analyze and summarize the results, and to explain and present the outcome to others.

毎日の研究活動の他に、毎週の研究報告会に参加すること。

Students will need to attend weekly lab meetings (the progress report) besides engaging in their daily research activities.

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自分の研究に関連する原著論文をPubMed等で探して読み、その内容を研究計画や結果解析等について考える材料にすること。　

Students will need to find through a search engine (e.g. PubMed) and read original papers that are related to their research theme, in order to make good use of the contents of such papers for their research planning and analyses of their results.

研究態度と研究成果を総合的に判断する。　

Evaluated by their performance and enthusiasm in their research activity and the results of the research as a whole.

・S：到達目標を十分に達成し、極めて優秀な成果を収めている
・A：到達目標を十分に達成している
・B：到達目標を達成している
・C：到達目標を最低限達成している
・D：到達目標を達成していない
・-：学修成果の評価を判断する要件を欠格している

・S：Achieved outcomes, excellent result
・A：Achieved outcomes, good result
・B：Achieved outcomes
・C：Minimally achieved outcomes
・D：Did not achieve outcomes
・-：Failed to meet even the minimal requirements for evaluation

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教科書および一部の参考書は、MyKiTS (教科書販売サイト) から検索・購入可能です。
​https://gomykits.kinokuniya.co.jp/tokyorika/​​​

It is possible to search for and purchase textbooks and certain reference materials at MyKiTS (online textbook store).
​​https://gomykits.kinokuniya.co.jp/tokyorika/

研究テーマに関連する英語論文、総論を参考にする。　

Original papers and reviews, being related to the students' research, published in scientific journals.

【特別研究の概要】
1) 研究の立案に必要な該当研究分野の研究成果•現状について、学術論文を中心に資料収集を行い、研究方針を決定する。
2) 研究遂行に必要な研究技術•設備について議論し、新技術導入が必要な場合は技術修得のために関連研究室の教員と連携する。
3) 研究開始後は一ヶ月単位で成果の進捗状況を確認•議論し、問題が生じた場合はその解決法を議論する。
4) 成果は、１ヶ月に１回の頻度で研究室ゼミで発表し、他研究室教員と研究成果ならびに方針について意見交換する。
5) これら全般を通して、研究者・技術者としての基礎的技能を滋養することを目標とする

【授業計画】
第１回：生命科学基礎的研究手法の習得：情報解析の基本ルールを理解し、それに基づいて大規模データ解析を行う技術を習得する。
第２回：生命科学基礎的研究手法の習得：大規模シミュレーションを実施する方法を習得する。
第３回：生命科学基礎的研究手法の習得：大型コンピュータにアクセスして大規模シミュレーションを実施する方法を習得する。
第４回：生命科学基礎的研究手法の習得：高度な情報解析手法を習得する。
第５回：生命科学基礎的研究手法の習得：確率シミュレーションを実施する方法を習得する。
第６回：生命科学基礎的研究手法の習得：力学系のシミュレーション法を習得する。
第７回：生命科学基礎的研究手法の習得：シミュレーションを用いたパラメータ推定方法を習得する。
第８回：研究テーマの立案：研究室で進行中の研究を把握し、関連論文を参考にして、自分の研究テーマを１つ以上立案する。
第９回：研究計画：研究目標を定め、それに対する研究計画を立てる。
第１０回：研究計画：具体的な研究計画を立て、必要な技術について準備する。
第１１回：研究計画の実行：研究を開始する。
第１２回：研究計画の実行：計画どおりに実験を進める。
第１３回：研究計画の実行：計画どおりに実験を進め、それまでのデータを纏めて報告し、研究室のメンバーと議論し、必要なら計画を軌道修正する。
第１４回：研究計画の実行：さらに実験を進める。
第１５回：研究のまとめ：データをまとめて、結果を研究報告会で報告する。

【研究分野】　生命科学の数理解析研究 　　
がんなどの疾患について、発症機序や薬剤耐性獲得機序を解明するために数理モデルを構築し解析を実施する研究を行う。

[Outline]
1) Students need to collect and read scientific papers describing current progress of the corresponding research field that are necessary for planning of their research, and make their research plan.
2) Students need to discuss on technics and devises required for their research with colleagues, and, if necessary, collaborate with other laboratories to introduce new technologies.
3) After starting their research, students need to discuss about the results every month with instructors to find out solutions to any problems.
4) Students need to present their results at the lab meeting once a month, and discuss with colleagues about the results and future plans.
5) Through these activities, students will acquire basic skills for researchers or technical experts.

<!--[if !supportLineBreakNewLine]-->[Course plan]
I. Learning of basic methods for life science researches:
1. Students will learn basic rules for information analysis and how to analyze a large-scale data accordingly.
2. Students will learn how to perform large-scale computer simulations.
3. Students will learn how to perform large-scale computer simulations by accessing a super computer.
4. Students will learn advanced methodology of bioinformatics.
5. Students will learn how to perform stochastic simulations.
6. Students will learn how to perform simulations of dynamical systems.
7. Students will learn how to perform parameter estimations with computer simulations.
II. Decision of research subject:
8. Students will think of one or more research subject considering the researches on going in the laboratory and related papers.
III. Planning of the research:
9. Students will set a goal of the research and plan a road map.
10. Students will plan experiments in detail and investigate necessary methods.
IV. Execution of the research:
11. Students will start research.
12. Students will carry out the in silico experiments according to the plan.
13. Students will carry out the in silico experiments, analyze and present the data, discuss about the data with lab members, and plan the next step or revise the plan if necessary.
14. Students will carry out the in silico experiments as 13.
V. Summarizing the research:
15. Students will summarize the data, and present the results in the lab meeting.
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<!--[endif]-->
<!--[endif]-->

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特になし

Nothing in particular.

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